Index

A

abc_run() (in module jsmfsb.inference)

abc_smc() (in module jsmfsb.inference) abc_smc_step() (in module jsmfsb.inference)

B

bd() (in module jsmfsb.models)

D

dimer() (in module jsmfsb.models)

F

file_to_spn() (in module jsmfsb.smfsb_sbml)

I

id() (in module jsmfsb.models)

J

jsmfsb module jsmfsb.data module jsmfsb.inference module jsmfsb.models module

jsmfsb.sim module jsmfsb.smfsb_sbml module jsmfsb.spatial module jsmfsb.spn module

L

lv() (in module jsmfsb.models)

M

metropolis_hastings() (in module jsmfsb.inference) mm() (in module jsmfsb.models) mod_to_spn() (in module jsmfsb.smfsb_sbml) model_to_spn() (in module jsmfsb.smfsb_sbml) module jsmfsb jsmfsb.data jsmfsb.inference jsmfsb.models jsmfsb.sim jsmfsb.smfsb_sbml jsmfsb.spatial jsmfsb.spn

P

pf_marginal_ll() (in module jsmfsb.inference)

S

shorthand_to_spn() (in module jsmfsb.smfsb_sbml) sim_sample() (in module jsmfsb.sim) sim_time_series() (in module jsmfsb.sim) sim_time_series_1d() (in module jsmfsb.spatial) sim_time_series_2d() (in module jsmfsb.spatial) sir() (in module jsmfsb.models) Spn (class in jsmfsb.spn) step_cle() (jsmfsb.spn.Spn method)

step_cle_1d() (jsmfsb.spn.Spn method) step_cle_2d() (jsmfsb.spn.Spn method) step_euler() (jsmfsb.spn.Spn method) step_euler_1d() (jsmfsb.spn.Spn method) step_euler_2d() (jsmfsb.spn.Spn method) step_gillespie() (jsmfsb.spn.Spn method) step_gillespie_1d() (jsmfsb.spn.Spn method) step_gillespie_2d() (jsmfsb.spn.Spn method) step_poisson() (jsmfsb.spn.Spn method)